Сведенията за създаването на Шияковския манастир “Св. Архангел Михаил” над град Костинброд се губят във времето.
Мястото е едно от християнските места на вярата и местата свързани със Свети Архангел Михаил.

Съществуват различни легенди за възникването му, като най-известната от тях го свързва с времето на цар Иван Шишман, а друга твърди, че съществува още от византийско време. Тук винаги се е развивала културна, духовна и просветна дейност и манастира е бил част от Софийска (Мала) Света гора.
Въпреки неуточнения му произход се знае, че е съществувал по време на османското  владичество. Имало е и килийно училище.

През 1868–71г игумен на манастира е личният приятел на Левски от легията на Раковски Генадий Ихтимански - Скитника.
По негова инициатива през 1871г в манастира пристига Апостолът на свободата и заедно с няколко съратници поставят началото на Тайния революционен комитет в Костинброд и мястото е един от Паметниците на борбите за национално освобождение на България.

Старият храм е построен през 1849г и е осветен през 1850г. Но сградата била с нестабилни основи и неустойчива и през 1928г е съборена. Новият храм е построен през 1929г на 4-5м южно от старите основи.
След 9 септември 1944г в манастира са настанени войници от трудови войски и манастирското стопанство е съсипано. В последните години на XX век обителта е възстановена с даренията на благочестиви християни.

Празникът на манастира е 08.11- "Свети Архангел Михаил".
На 15.08. в Шияковския манастир местните жители празнуват "Успение Богородично".
На 19.02 пред паметника на Васил Левски в Шияковския манастир се поднасят официално венци от общинското ръководство, граждани и гости на манастира.

От 2012 г. заедно с обновлението на манастира е изградена и малка хотелска част за настаняване на поклонници.